首先安装 BiocManager::install("AnnotationDbi") 然后使用命令： install.packages("./org.Ma.eg.db/", repos=NULL) 意为安装本地./org.Ma.eg.db 目录下的R包，且不使用网络
GO分析中安装本地org.Ma.eg.db包
tidyverse包的安装
安装相关依赖 sudo apt-get install libfreetype6-dev libpng-dev libtiff5-dev libjpeg-dev libharfbuzz-dev libfribidi-dev libgtk-3-dev fontconfig ibxml2-dev libcurl4-openssl-dev libssl-…
生信环境配置
0.其他小工具软件 sudo apt-get install htop 1.安装fastq等依赖项 sudo apt install cutadapt fastqc python3-pip 很简单一行命令就行 2.安装trim_galore sudo pip3 install --user --upgrade cutadapt sudo wget …
Picard的安装
主要是java环境问题 java 检查当前可用的 Java 运行环境版本，可以使用以下命令： update-java-alternatives --list 输出结果会显示系统上安装的所有 Java 运行环境版本。 设置正确的 Java 运行环境版本，可以使用以下命令： sudo update-java-alternatives --set /pa…
motif的制作
作图代码 四、motif_seqlogo图 输入文件：05.motif/knownResults里面的motif file (matrix) 一般为后缀为.motif的文件 把.motif 文件使用文件编辑器打开 复制上面红框中的东西 粘贴到Excel中，标上1、2、3、4等 然后使用Excel的转置功能 转成横行 然后通过之前的图 ，标记上A…