1. samtools view sam转bam view命令的主要功能是：将sam文件转换成bam文件；然后对bam文件进行各种操作，比如数据的排序(不属于本命令的功能)和提取(这些操作 是对bam文件进行的，因而当输入为sam文件的时候，不能进行该操作)；最后将排序或提取得到的数据输出为bam或sam（默认的）格式。 bam文件优点：bam文件…
samtools的使用之samtools view（sam转bam
ncbi blast
ncbi blast https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
配置zerotier moon服务器
00.服务器购买后第一反应 有了买服务器送的独立ip,我第一反应就是安装一个zerotier moon服务器以加速访问这个服务器的系统为我从未使用过的Centos，就当顺便学习centos了吧。 01.安装遇到的问题与解决问题 搜到的教程中，安装命令很简单： curl -s https://install.zerotier.com/ sudo ba…
一点随笔
在把自己笔记往这个博客上搬的时候，偶然想起自己两三年前好想同样制作过博客，就去翻了一下硬盘，果然让我找到了！ 于是就去搜索有没有能把xml转成md文件的脚本，不出乎意外的也找到了：wd转md 转换好之后，真的是有点唏嘘了，想了想还是把它们导入进来吧。 下面贴一下 ...
GO分析中安装本地org.Ma.eg.db包
首先安装 BiocManager::install("AnnotationDbi") 然后使用命令： install.packages("./org.Ma.eg.db/", repos=NULL) 意为安装本地./org.Ma.eg.db 目录下的R包，且不使用网络
tidyverse包的安装
安装相关依赖 sudo apt-get install libfreetype6-dev libpng-dev libtiff5-dev libjpeg-dev libharfbuzz-dev libfribidi-dev libgtk-3-dev fontconfig ibxml2-dev libcurl4-openssl-dev libssl-…
个人NAS的搭建
0.系统及配置选择 系统使用的是ESXI，版本:7.0 Update 3 cpu 主板 内存 显卡 主硬盘 机箱 系统 qn8j 豆希b365 16g* 2 Tesla p4 1tSSD 6盘位itx ESXI 7U3 1.系统安装 官网、镜像站下载iso镜像并写入u盘，为了节约盘位，我将系统安装至另外一个u盘上， 从安装（20230609）至今（…
生信环境配置
0.其他小工具软件 sudo apt-get install htop 1.安装fastq等依赖项 sudo apt install cutadapt fastqc python3-pip 很简单一行命令就行 2.安装trim_galore sudo pip3 install --user --upgrade cutadapt sudo wget …
安装生信必须软件
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Picard的安装
主要是java环境问题 java 检查当前可用的 Java 运行环境版本，可以使用以下命令： update-java-alternatives --list 输出结果会显示系统上安装的所有 Java 运行环境版本。 设置正确的 Java 运行环境版本，可以使用以下命令： sudo update-java-alternatives --set /pa…