月度归档: 2023 年 11 月

2 篇文章

使用augusts来进行基因预测
生成内含子提示:使用bam2hints工具从你的BAM文件中生成内含子提示。这个工具可以从RNA-Seq比对中提取出内含子的信息 bam2hints --intronsonly --in=merged.bam --out=intron_hints.gff 生成覆盖度文件:使用bam2wig工具从你的BAM文件中生成覆盖度文件(bigwig格式)。这…
Jbrowse在添加新物种时遇到的问题
在加入尖孢镰刀菌古巴专化型菌:NCBI地址的时候,使用脚本: IN='/var/www/html/JBrowse-1.16.9/Foc_4/data'; OUT='Foc_4_try'; set -e; set -x; # format the reference sequences /var/www/htm…